九十九科学是年仅十三岁便具备丰富知识的天才科学家。他靠着各类物理轨则、科学理论以及夸张的想像力，企图不靠石化燃料上岸月球。为了实现目标，九十九科学和助手兼美少女型技巧实验卫星机械人菊八号一起进行各类实验。