连续旅行的小智一行人，来到了被丰富自然的河川围绕的城镇米季纳。这个城镇里拥有数千年前的遗迹，小智等人在巨年夜的岩山上朝遗迹前进。突然，遗迹邻近的湖刮起了水龙卷并向小智等人逼进，就在快被龙卷风卷入时，随着“帝牙卢卡，请托了！”的声音涌现了一名女性。下一刻，撕开空间的帝牙卢卡涌现了。这位名叫“希娜”的女性，是遗迹的守护者，拥有与神奇瑰宝心灵相通的能力。在希娜的邀请下，让小智他们使用时空仪来说明有关帝牙卢卡、帕路奇犽、骑拉帝纳的空间，并说起了在米季纳关于被称为出生一切的幻之神奇瑰宝“阿尔宙斯”的古老传说…。