主角建次与自己的父亲原本生活在史前时代，遇到了补捉时空怪兽的邪恶女王一行人与时空怪兽爱爱，后来跟和父亲被邪恶女王酿成化石流传到25世纪的日本，被双胞胎姐弟小柔与阿时发明，之后被时空王国的国王变回原形，奉时空治理局之命，抓回因为时空王国被进击而流落到各个时空的时空怪兽。