公元2195年，谜一般的武器群“木星蜥蜴”突然涌现，并以压倒性的战斗力占领了火星的殖民地以及月球的后头。地球的各地均有被称为“郁金香”的母舰下降。与此同时，民间企业ネルガル重工‎NERGAL完成了实验战舰ND-001ナデシコNadesico的扶植。即使是对着木星蜥蜴的武器，装备在抚子号上的武器依然具有技巧上的优势，包含扭曲力场 (Distortion Field) 防护罩以及重力波炮，使得抚子号成为了其时唯一能与木星蜥蜴抗衡的战舰。在人员的任命上，由于采取了“能力一流，不问性格”的选拔方针，成果使得整艘舰的工作人员都是些有点“特殊性格”的人。火星出身的主角天河明人，在一次偶然的机会遇见了儿时玩伴御统百合香。想再次与百合香相会的明人，一直跟在她的后面，并意外地登...