由于在现实生活中太过不顺，加上空地也无法玩耍，年夜雄和他的伙伴小夫、胖虎和静香决定进行史上最年夜范围的离家出走。同时，由于产生时空错乱，一名名叫古古儿的远古时代中国人来到20世纪的东京，后被年夜雄等发明，带到七万年前。原来古古儿所在的光亮族被阴郁族侵略，而阴郁族的首领是来自未来世界的巨尊比，他妄图转变世界历史，然则在时光巡逻队的协助下，最后巨尊比的阴谋破产，而古古儿和他的部族来到了日本，成为日本人的始祖。舞台在七万年前的中国。