知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飘动中，他来拜领无价的“命运的宝石”。毛利小五郎受到牧树里委托将信件剖析，认为基德将在演出最后一晚前来窃取宝石，当晚他及柯南、小兰等人来到剧场，那里早有诸多警察守候。令柯南受惊的是，基德竟扮成工藤新一涌现在众人面前，但他及众人偏向不合的紧张事后，宝石并没被盗，柯南醒悟字母预告信与航班相关。 而柯南、小兰、牧树里及其同事搭乘的前往北海道的飞机上，尚有一起杀人筹划正被精心设计……